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Mots-clés : outils numériques, pharmaceutique, médicaments, protéines, molécules chimiques, toxicité

La quantité de données en ligne est trop importante pour être totalement exploitée manuellement par l’Homme. Des outils numériques (algorithmes et logiciels) ont été développés pour les manipuler : ils permettent de récupérer les données pour les utiliser et éventuellement générer des hypothèses pour concevoir de nouveaux médicaments. Cela passe, entre autres, par l’étude de données relatives aux petites molécules chimiques d’intérêt pharmaceutique et aux poches de liaisons de protéines. Il est également possible d’envisager le repositionnement de médicaments et de prédire la toxicité de molécules.

Partie des programmes associées :

  • Programme d’enseignement scientifique de terminale : Thème 3 – Une histoire du vivant & Thème 3.5 – Intelligence artificielle
  • Programme de terminale STL spécialité : S33 – Cycle cellulaire cancer et cellules souches & L4 – Mobiliser les outils numériques en biotechnologie
  • Programme de CPGE : Chimie du et pour le vivant / La chimie dans les processus du vivant
  • Programme de DUT Chimie : Chimie du vivant
Auteur(s) : Philippe Thomas
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Mots-clés : liaison chimique, fréquence de vibration, forces orbitaires, propellane

Qualifier une orbitale moléculaire de liante ou antiliante est une chose bien connue dans l’enseignement, mais il est plus difficile de les définir quand on veut les calculer. L’article trace un large panorama sur ces notions en les reliant aux forces exercées par les électrons sur les noyaux. Les auteurs présentent les résultats de la recherche actuelle sur les forces orbitalaires avec la spectrophotométrie photoélectronique (UV lointain) et donnent une application pour une liaison exotique dans le cas du propellane.

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Auteur(s) : Patrick Chaquin, François Volatron et Franck Fuster
Source : L’Actualité chimique n° 447 (janvier 2020) pp. 28-39
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Mots-clés : pigments, spectrométrie de fluorescence X, accélérateur Aglaé, La Joconde

L’auteur revient sur l’exposition exceptionnelle au Musée du Louvre d’octobre 2019 à février 2020 et répond aux questions suivantes : quels sont les pigments que Léonard de Vinci utilisait pour peindre ? Quelles techniques ? Pourquoi la réflectographie IR révèle les dessins préparatoires et les hésitations de l’artiste dans L'Adoration des Mages ?

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Auteur(s) : Bernard Valeur
Source : L’Actualité chimique n° 447 (janvier 2020) pp. 6-9
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Mots-clés : polyamide, PET, PA 6-6, contrainte, allongement, structure

Si les propriétés mécaniques de la soie d’araignée sont voisines de celles des polyamides artificiels (par exemple le PA 6-6) ou de la soie des vers à soie, la synthèse par génie génétique (introduction de gènes d’araignée) ne donne encore actuellement que des fibres trop courtes par rapport aux fibres naturelles de la soie des vers à soie !

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Auteur(s) : Philippe Colomban
Source : L’Actualité chimique n° 441 (juin 2019) pp. 91-32
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Mots-clés : unités

Il s’agit ici de revenir sur les nouvelles définitions de quatre unités de base du système international (SI) : le kilogramme, l’ampère, la mole et le kelvin. Ces unités attribuent maintenant des valeurs numériques fixées à quatre constantes : la constante de Planck, la charge élémentaire, la constante d’Avogadro et la constante de Boltzmann. Les trois unités restantes de base : la seconde, la vitesse de la lumière et le candéla ne sont pas modifiées car elles font appel à des valeurs numériques fixées à savoir respectivement, la fréquence de transition du 133Cs , le mètre, la constante Kcd (qui intervient dans la définition de la candela). Cependant, leurs définitions sont réécrites. Le nouveau système est entré en application depuis le 20 mai 2019. La mole est l’unité de la quantité de matière et contient exactement 6,022 140 76 x 1023 unités élémentaires.

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Auteur(s) : Lucile Julien
Source : L’Actualité chimique n° 441 (juin 2019) pp. 6-8
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Mots-clés : cage moléculaire, caténane, graphène, graphite, machine moléculaire, macrocycle, matéraiau nanocomposite, matériau nanoporeux, matériau nanostructuré, muscle moléculaire, nanocapsule, nanomatériau, nanoobjet, nanoparticule, nanotube, rotaxane

On trouve ici les définitions de plusieurs termes du domaine des nanomatériaux et des machines moléculaires, résultant des travaux de Jean-Pierre Sauvage, Prix Nobel de Chimie en 2016, ainsi que leurs équivalents étrangers.

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Auteur(s) : Claude Andrieux
Source : L’Actualité chimique n° 440 (mai 2019) pp. 10-12
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Mots-clés : chémobiologie, fluorescence, bioimaginerie, marqueurs fluorogéniques

La microscopie optique permet d’observer le vivant à une échelle submicronique. Le développement de marqueurs fluorescents de plus en plus performants rend possible de suivre la dynamique des biomolécules avec un résolution spatiale temporelle sans précédent : un bel exemple où la chimie et la biologie permettent non seulement « d’observer » mais aussi de « suivre » ces transformations !

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Auteur(s) : Arnaud Gautier
Source : L’Actualité chimique n° 435 (décembre 2018) pp. 31-35
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Mots-clés : chimie supramoléculaire, catalyseur métallique, catalyse énantiosélective, amplification de chiralité

La synthèse asymétrique est très utilisée notamment dans la synthèse des médicaments. Ici le catalyseur est formé en utilisant un complexe ente un métal et des ligands greffés sur des polymères supramoléculaires qui adoptent une configuration hélicoïdale donc chirale. Cette technique permet de moduler la synthèse de tous les stéréoisomères possibles du produit d’une réaction, ceci est important en pharmacie lors des études de validation où l’on exige de tester tous les stéréoisomères.

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Auteur(s) : Matthieu Raynal et Laurent Bouteiller
Source : L’Actualité chimique n° 430-431 (juin-juillet-août 2018) pp. 37-41
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Mots-clés : métaux stratégiques, liquides ioniques, hydrométallurgie

Les produits de haute technologie de la vie quotidienne comme les ordinateurs, téléviseurs, téléphones portables… utilisent des métaux précieux et rares dans un environnement géopolitique parfois instable. L’indium et le lanthane sont des exemples proposés dans l’article. Des procédés d’électrodéposition du lanthane et de l’indium par utilisation de liquides ioniques sont ici présentés.

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Auteur(s) : M. Draye et coll.
Source : L’Actualité chimique n° 427-428 (mars-avril 2018) pp. 100-104
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Mots-clés : ressource non alimentaire, eutectiques, solvants protiques et aprotiques

Dans le but d’utiliser des solvants plus durables dans la synthèse de principes actifs notamment dans le domaine de la pharmacie, l’industrie regroupe les douze principes de la chimie verte en six thèmes : énergie, technologie, veille, rejets, réaction, matière renouvelable. Le point d’ébullition est un indicateur d’utilisation industrielle. Des critères d’évaluation sont établis et un guide de solvants appropriés est proposé en conclusion.

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Auteur(s) : Philippe Marion et François Jérôme
Source : L’Actualité chimique n° 427-428 (mars-avril 2018) pp. 91-94
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